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山東大學公共衛(wèi)生學院導師--薛付忠簡介

2012-03-03 10:33   來源:未知   作者:admin    點擊:

摘要:姓名 薛付忠 性別 男 出生年月 1964-05 學歷 博士研究生 學位 博士學位 專業(yè)技術職務及聘任時間 副教授 [] 行政職務 副院長 博導聘任時間 2010-05-07 所在學院 公共衛(wèi)生學院 所在一級學科名稱 公共衛(wèi)生與預防醫(yī)學 學科代碼 1004 所在二級學科名稱 流行病與衛(wèi)

姓名  薛付忠 性別  男 出生年月  1964-05  
學歷  博士研究生 學位  博士學位
專業(yè)技術職務及聘任時間  副教授 [] 行政職務  副院長
博導聘任時間  2010-05-07
所在學院  公共衛(wèi)生學院
所在一級學科名稱  公共衛(wèi)生與預防醫(yī)學 學科代碼  1004
所在二級學科名稱  流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計學 學科代碼  100401
研究方向   【空間流行病學、復雜疾病基因定位試驗設計與統(tǒng)計分析方法研究】
學術身份  
學術兼職  兼任中國衛(wèi)生信息學會醫(yī)學統(tǒng)計教育專業(yè)委員會常務委員,中國衛(wèi)生信息學會醫(yī)學統(tǒng)計學理論與方法學專業(yè)委員會委員,山東省臨床流行病學學會副主任委員等職。

 
研究領域簡介
研究方向1:空間流行病學與空間遺傳學理論方法及其應用研究
近年來,隨著地理信息系統(tǒng) (GIS) 的迅速發(fā)展 , 地理流行病學和基因地理學與 GIS 和空間統(tǒng)計學等學科有機結合,開始向更高層次的空間流行病學和空間遺傳學發(fā)展;國內(nèi)外在此領域的研究尚處于起步階段。本課題組一直將“空間流行病學與空間遺傳學理論方法及其應用”作為重要研究方向之一。
在空間流行病學理論與方法研究方面主要是在傳統(tǒng)地理流行病學基礎上,在GIS框架下,重點研究“疾病空間分布的概率生成模型,疾病空間分布狀態(tài)量化統(tǒng)計指標,疾病空間估計方法,疾病空間分布趨勢面模型理論方法及其偏倚控制,疾病空間異質(zhì)模型及其流行病學含義,疾病地理界限識別及疾病地理區(qū)劃定量方法,流行病學標點地圖統(tǒng)計推斷方法”等領域。在空間流行病學應用研究方面,重點研究腎綜合征出血熱和結核病等重大傳染病的空間流行病學特征、時空傳播軌跡追蹤及其區(qū)域化預防控制措施的制定。
在空間遺傳學理論與方法研究方面主要是針對傳統(tǒng)基因地理學方法的不足,在GIS框架下,重點研究“基因頻率矩陣降維綜合的非線性多元分析方法和群體遺傳結構分析的Biplot模型,人類群體遺傳空間結構變異函數(shù)模型及其群體遺傳學參數(shù),人類群體遺傳空間結構的地理遺傳梯度及地理界限識別,人群基因流動空間軌跡統(tǒng)計推斷,人類群體遺傳空間結構成分的定量分解”等領域。在空間遺傳學應用研究方面,重點研究“疾病易感基因多態(tài)性(HIV感染相關基因、HBV基因、ACE基因、細胞色素基因、HLA基因等)的空間遺傳學和空間流行病學特征及其應用,中國HLA限制性多表位疫苗的理論免疫應答率預測系統(tǒng),基于細胞色素基因家族的中國藥物基因組學及區(qū)域化個性治療規(guī)劃,基于STR多態(tài)性的中國區(qū)域化法醫(yī)DNA參考數(shù)據(jù)庫空間布局,基于全基因組SNP標記的中國漢族人群空間遺傳結構界限識別及其復雜疾病基因定位的空間病例對照研究設計,基于Y染色體、mtDNA,HLA、STR,SNP等遺傳標記的中國南北人群遺傳結構及其地理界限識別”等領域。
在該研究方向上,主持完成了“基因空間異質(zhì)性理論與定量分析方法的研究 (30170527 ) 、地理流行病學統(tǒng)計分析方法研究 (30070677 ) 和小地域生態(tài)環(huán)境內(nèi)腎綜合征出血熱的地理流行病學機制研究 (30471489) ” 三項國家自然科學基金項目;中國博士后基金項目“中國人群精細遺傳結構的地理信息系統(tǒng)研究(2005038128)”,山東省醫(yī)藥衛(wèi)生十五攻關項目“山東省腎綜合癥出血熱綜合防治策略基礎研究”,山東省自然科學基金項目“疾病空間分布的統(tǒng)計模型研究”,和艾滋病全球基金項目“山東艾滋病地理信息管理系統(tǒng)研究”及“山東省HIV-1感染相關基因多態(tài)性的地理流行病學研究與應用”,以及奧運會橫向合作項目“青島市食品安全時空預警系統(tǒng)”等多項課題。在國內(nèi)外學術刊物發(fā)表論文30余篇;“中國HLA限制性多表位疫苗的理論免疫應答率預測系統(tǒng)”獲國家專利,“空間流行病學技術方法研究及其在腎綜合征出血熱防控中的應用”獲山東省科技進步三等獎。
目前,在該研究方向上正在主持承擔“國家傳染病重大專項分題-耐多藥結核病流行因素的生態(tài)學研究(008ZX10003-007),國際合作項目“人類遷徙圖計劃分題——東亞人群基因地理學研究”等課題。
研究方向2:復雜疾病基因定位試驗設計及其統(tǒng)計分析方法研究
全球第一輪全基因組關聯(lián)分析(GWAS) 高潮已初戰(zhàn)告捷,但其成果并不理想,與期望差距甚遠;這與其試驗設計和數(shù)據(jù)分析中某些關鍵問題有關。試驗設計上,多是單一疾病(表型)病例對照或病例隊列設計,缺乏針對疾病綜合潛在表型從其連續(xù)數(shù)量表型變異維度上闡明基因組變異與疾病發(fā)生、發(fā)展和轉(zhuǎn)歸結局關系的縱向GWAS設計理念;數(shù)據(jù)分析上,多是單一SNP與單一性狀關聯(lián)分析,缺乏以整體基因(或非基因區(qū)域)為單位分析其與綜合潛在表型動態(tài)關聯(lián)性的推斷方法。針對這些不足,近年來本課題組一直致力于“疾病綜合潛在表型的整體基因(whole gene-baed)和基因組區(qū)域化(Genome-wide region-based)關聯(lián)分析及其交互作用統(tǒng)計推斷方法”的研究,旨在為GWAS數(shù)據(jù)分析提供高效的新方法,提高其科學性和成果價值。
在該研究方向上,主持完成了“國家“863”項目‘復雜疾病基因定位研究的基因(環(huán)境)交互作用與遺傳交互網(wǎng)絡模型構建及其軟件系統(tǒng)的開發(fā)’(2007AA02Z312)’,國家自然科學基金項目‘基因空間異質(zhì)性理論與定量分析方法研究’(30170527)”等課題。發(fā)表論文近10余篇,6篇被SCI收錄。
目前,在該研究方向上正在主持承擔“國家自然科學基金項目‘基于核典型相關理論的整體基因之間交互作用統(tǒng)計推斷方法的研究(30871392)’、國家自然科學基金重大項目子分題‘中國人群基因組多態(tài)性的分子標記及相關研究--中國(漢族)群體遺傳結構及其對復雜疾病關聯(lián)分析影響的研究’(30890034-3)等課題。
研究方向3: 中藥藥性理論的統(tǒng)計分析方法研究
“中藥藥性基礎理論問題”的核心是“中藥是一種客觀實在,藥性是其本質(zhì)屬性的主觀反映,功效是本質(zhì)屬性的客觀表現(xiàn),藥性通過功效得以體現(xiàn)。藥性理論是性、味、歸經(jīng)等要素相互關聯(lián)的復雜理論。功效是體現(xiàn)藥性的核心,物質(zhì)成分是產(chǎn)生藥性的基礎,但某種物質(zhì)成分或某一藥效作用均不能表征中藥整體藥性。藥性-藥效-物質(zhì)間的關系是中藥藥性理論現(xiàn)代研究的關鍵。構成中藥藥性理論的三個核心元素是藥性、物質(zhì)、功效”。為了驗證這一核心理論,推動中醫(yī)藥現(xiàn)代化進程,近年來本教研室致力于研究“基于中藥化學圖譜的中藥藥性特征標記統(tǒng)計模式識別模型,藥性與經(jīng)驗要素、性狀要素、成分要素、功效要素關系的統(tǒng)計推斷方法,‘中藥藥性-藥效-物質(zhì)三元理論體系’的交互網(wǎng)絡模型”等重點攻關領域。
目前,在該研究方向上正在承擔國家“973”項目--“中藥藥性理論相關基礎問題研究”(2007CB512600)的統(tǒng)計分析任務,并主持子課題子分題—中藥藥性理論的數(shù)據(jù)管理與分析平臺及其數(shù)學模型構建(2007CB512601-5)。
研究方向4:醫(yī)學統(tǒng)計模式識別理論方法及其應用研究  
近年來,轉(zhuǎn)化醫(yī)學研究被認為是“驅(qū)動臨床研究引擎的激發(fā)器”,已經(jīng)成為現(xiàn)代和未來醫(yī)學研究的主要模式和發(fā)展方向;轉(zhuǎn)化醫(yī)學研究已經(jīng)成為國際上醫(yī)學研究的熱點問題。其中,“轉(zhuǎn)化醫(yī)學臨床病例隨訪隊列示范平臺建設及其數(shù)據(jù)采集與統(tǒng)計分析方法”是當前轉(zhuǎn)化醫(yī)學領域亟待解決的關鍵領域之一。該領域涉及如何建立轉(zhuǎn)化醫(yī)學研究成果的孵化、評價和推廣應用示范平臺及其管理運行機制,如何確定其推廣應用的關鍵領域及其解決方案,如何建立科學的數(shù)據(jù)信息采集、管理和統(tǒng)計分析方法體系等一系關聯(lián)問題。針對這些問題,本課題組在轉(zhuǎn)化醫(yī)學方面的重點攻關領域包括:“重大疾病轉(zhuǎn)化醫(yī)學臨床病例隨訪隊列示范平臺建設,基于生物標記與臨床標記的疾病計量診斷模型研究,疾病轉(zhuǎn)歸機制的網(wǎng)絡模型研究、疾病轉(zhuǎn)歸預警系統(tǒng)研究,臨床決策系統(tǒng)的統(tǒng)計模型研究,個性化治療統(tǒng)計分析方法研究、疾病轉(zhuǎn)歸風險評估指標體系與統(tǒng)計模型研究,生物標記臨床應用價值評價,制定臨床路徑的統(tǒng)計分析方法研究”等。
目前,在該研究方向上,正在承擔“國家科技支撐計劃項目‘重大神經(jīng)精神系統(tǒng)疾病的預警指標體系研究與預警模型開發(fā)’(2008BAI52B03)”。
 
國內(nèi)外學習和工作經(jīng)歷
1986 年畢業(yè)于山東省淄博衛(wèi)生學校,同年分配至山東省平邑縣衛(wèi)生防疫站從事流行病學現(xiàn)場工作。1992 年畢業(yè)于原山東醫(yī)科大學預防醫(yī)學專業(yè),1999 年獲山東大學衛(wèi)生統(tǒng)計學專業(yè)碩士學位,2005 年獲山東大學流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計學專業(yè)博士學位,2005 年-2007 年在復旦大學現(xiàn)代人類學教育部重點實驗室完成了統(tǒng)計遺傳學與群體遺傳學專業(yè)博士后研究,2009 年9 月-2010 年8 月在英國劍橋大學-MRC 流行病學研究所做訪問學者,主要從事隊列研究GWAS 數(shù)據(jù)分析和建模的合作研究。
年度招生計劃
博士研究生每年招收計劃1-2名
論文、著作、專利
Peng Q, Zhao J, Xue F*(通訊作者). PCA-based bootstrap confidence interval tests for gene-disease association involving multiple SNPs. BMC Genet. 2010 Jan 26;11(1):6.
Peng Q, Zhao J, Xue F*(通訊作者). A gene-based method for detecting gene-gene co-association in a case-control association study. Eur J Hum Genet. 2009 Dec 23. [Epub ahead of print]
Zheng Q, Shi Y, Yang Z, Xu X, Wang L, Xue F, Gu HF, Chen ZJ. Family-based association study of the MCF2L2 gene and polycystic ovary syndrome. Gynecol Obstet Invest. 2009;68(3):171-3. Epub 2009 Jul 31.
Xue F, Wang Y, Xu S, Zhang F, Wen B, Wu X, Lu M, Deka R, Qian J, Jin L. A Spatial Analysis of Genetic Structure of Human Populations in China Reveals Distinct Difference between Maternal and Paternal Lineages. Eur J Hum Genet. 2008 Jan
23 [Epub ahead of print]
Xue F, Wang J, Hu P, Ma D, Liu J, Li G, Zhang L, Wu M, Sun G, Hou H. Identification of spatial genetic boundaries using
a multifractal model in human population genetics. Hum Biol. 2005; 77(5):577-617
Xue FZ, Wang JZ, Ma DX,Li GR, Hu P. Spatial genetic structure of two HIV-I-resistant polymorphisms (CCR2-64 I and
SDF1-3'A) alleles in population of Shandong Province, China. Biomed Environ Sci. Aug 2005(18):241-253
Xue FZ, Wang JZ, Hu P, Li GR. The “Kriging” model of spatial genetic structure in human population genetics.Yi Chuan Xue Bao(遺傳學報). Mar 2005(32):219-233
XUE Fu-zhong, WANG Jie-zhen, HU Ping, GUO Yi-shou, LI Guo-rong. Forecasting system on spatial coverage of cumulative phenotypic frequency of HLA class Ⅰ for designing HLA-based vaccines in China. 免疫學雜志.
2005(21):136-141
彭倩倩,薛付忠*(通信作者).permutation-PCA 方法在病例對照關聯(lián)分析中不同遺傳模型下的表現(xiàn). 山東大學自 然科學學報(醫(yī)學版),2009,03(47):94-97
張茜,薛付忠*(通信作者).類群體遺傳空間結構分析的典型趨勢面模型. 山東大學自然科學學報(醫(yī)學版)2009;第2 期
薛付忠, 王潔貞, 郭亦壽, 胡平. 人類群體遺傳結構雙標圖模型及其應用. 科技導報. 2006(24):16-24
薛付忠, 王潔貞, 郭亦壽, 胡平. 人類群體遺傳空間結構對應分析中的“蹄型效應”及其校正方法. 中國衛(wèi)生統(tǒng)計.2006(23):194-198
薛付忠, 王潔貞, 張娜, 胡平. 人類群體遺傳結構的圖論主坐標分析方法. 山東大學學報(醫(yī)學版). 2006(44):109-113
薛付忠, 王潔貞, 胡平. 中國人群胰島素依賴性糖尿病HLA-DQ 基因多態(tài)性的Meta 分析. 中華內(nèi)分泌與代謝雜 志. 2005(21):39-42
薛付忠, 王潔貞, 郭亦壽, 胡平, 王振光. 人類群體遺傳結構的圖論主成分分析方法. 中國衛(wèi)生統(tǒng)計. 2006(23):194-198
薛付忠, 王潔貞, 郭亦壽, 胡平. 人類群體遺傳空間結構對應分析中的“蹄型效應”及其遺傳學解釋. 遺傳. 2005(27):972-979
薛付忠, 王潔貞, 郭亦壽, 胡平. 人類群體遺傳空間結構的均值化協(xié)方差陣主成分分析. 人類學學報. 2005(24):221-231
薛付忠, 王潔貞, 郭亦壽, 胡平, 吳學森. 等位基因多態(tài)性群體遺傳結構的多元非線性分析方法. 遺傳學報.2004(31):202-211
薛付忠, 王潔貞, 胡平. 中國人群胰島素依賴性糖尿病HLA-DR 基因多態(tài)性的Meta 分析. 山東大學學報(醫(yī)學版).2004(42):534-539
衛(wèi)生部研究生規(guī)劃教材《統(tǒng)計分析在醫(yī)學課題中的應用》 人民衛(wèi)生出版社,編委
研究生規(guī)劃教材《流行病學研究方法與應用(第二版)》科學出版社,編委
教育部本科生規(guī)劃教材《醫(yī)學統(tǒng)計學(第2版)》高等教育出版社,編委
衛(wèi)生部臨床八年制規(guī)劃教材《醫(yī)學統(tǒng)計學》,人民衛(wèi)生出版社,編委
 
科研項目
近3年主持的科研項目
1.國家“973”項目分題,“中藥藥性理論相關基礎問題研究” (2007CB512600)(任整個“973”項目統(tǒng)計分析組組長),并主持子課題子分題—中藥藥性理論的數(shù)據(jù)管理與分析平臺及其數(shù)學模型構建(2007CB512601-5)),(總經(jīng)費50萬元)。
2.國家自然基金項目,基于核典型相關理論的整體基因之間交互作用統(tǒng)計推斷方法的研究(30871392),經(jīng)費31萬元。
3.國家自然科學基金重大項目分題子課題,中國人群基因組多態(tài)性的分子標記及相關研究(30890034);負責分題——中國(漢族)群體遺傳結構及其對復雜疾病關聯(lián)分析影響的研究(30890034-3),經(jīng)費 20萬元
4. 國際合作項目,人類遷徙圖計劃分題——東亞人群基因地理學研究,總經(jīng)費30萬元
5.山東艾滋病地理信息管理系統(tǒng)研究(GS-2007-04),艾滋病全球基金項目,經(jīng)費2萬元;
6.國家傳染病重大專項分題-耐多藥結核病流行因素的生態(tài)學研究,經(jīng)費31.5萬元
7.復雜疾病基因定位研究的基因(環(huán)境)交互作用與遺傳交互網(wǎng)絡模型構建及其軟件系統(tǒng)的開發(fā)(2007AA02Z312),經(jīng)費104萬元;
8.“重大神經(jīng)精神系統(tǒng)疾病的預警指標體系研究與預警模型開發(fā)”(2008BAI52B03)
 
獲獎項目
(1)空間流行病學技術方法研究及其在腎綜合征出血熱防控中的應用 省科技進步三等獎
(2)中國HLA限制性多表位疫苗的理論免疫應答率預測系統(tǒng),國家專利
主講課程
《醫(yī)學統(tǒng)計學》,《多元統(tǒng)計分析與SAS應用》,《復雜疾病基因定位試驗設計與統(tǒng)計分析方法》
培養(yǎng)研究生情況
目前共培養(yǎng)碩士研究生十余名,2011年開始招收博士研究生。
聯(lián)系方式
電話:0531-88380280, 13906405997
電子信箱:xuefzh@sdu.edu.cn
Email:xuefzh@sdu.edu.cn
郵編:250012
 
本人培養(yǎng)的研究生適合從事的工作領域
(1)疾病預防控制;(2)醫(yī)院臨床試驗設計與統(tǒng)計分析
(3)高等醫(yī)藥院校:(4)生物醫(yī)藥公司

(責任編輯:admin)

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